华润与北药结缘始于华源集团重组。2006年2月16日，华润受国务院国资委的委托重组华源集团。由此，华润接手华源集团所持北药集团50%的股权，北药集团另外50%的股权分别由北京市国资委及其旗下公司所持。

此后，华润一直维持与北京市国资委共同持有北药集团股权的格局。借助此次华润与北京市政府实施战略合作的契机，在华润集团领导的全力支持和协调下，华润人凭着一份执着与坚守，终于迎来了双方合作的机会。

根据战略合作框架协议，北京市政府将支持双方医药资源重组整合，积极推进华润医药板块和北京医药集团有限责任公司的战略重组和整体上市，并籍此提升行业地位，在北京共同打造国内生物医药产业龙头。

框架协议签署之后，华润与北京市国资委对北药集团与华润医药集团的尽职调查和资产评估工作相继开展。在完成尽职调查和资产评估的基础上，双方进行了多个回合的谈判，解决了有关重组路径、公司治理结构、董事会、管理层人员安排、交易对价等重大问题，为重组后合资公司的快速发展创造了条件。

2010年7月30日，华润与北京市国资委签署了《北京医药集团有限责任公司及华润医药集团有限公司的重组协议》。根据协议，华润与北京市国资委将积极推进并完成双方医药资源的整合工作，共同实现在北京打造国内生物医药产业龙头企业、建立国家级医药产业基地的战略目标。

协议的签署，标志着华润和北京市政府在发展生物医药产业方面的合作进入了一个崭新阶段，同时也将成为推进北京医药产业资源进一步快速集聚，实现跨越式发展，促进首都生物医药产业由战略性产业向主导性产业加快转变的助推器。

重组协议签署后，双方立即开始着手研究股权重组有关事项，并按照双方协商确定的重组步骤予以实施。重组完成后，华润医药集团和北药集团的医药类资产将被纳入一家合资公司，华润和北京市国资委旗下的国管中心将共同直接或间接持有合资公司的全部股权。

为了充分实现华润医药集团与北药集团两个总部的职能重建、人员整合，满足各业务单元与新的管理总部之间沟通磨合的需要，华润北药成立了过渡期领导小组和6个过渡工作小组。其职能设置为：打破股权关系的界限，从职能体系构建的角度与业务单元直接对接；推进体系建设，强化交流与沟通，落实各单位之间的战略合作；加强组织能力建设，提升集团价值。

新成立的华润北药集团有限公司将在北京建立战略管理、研发和市场营销中心，同时建立现代化的医药生产及医药分销物流基地，把高附加值的药品制造和生物医药优先放在北京发展，积极推进华润集团医药板块和北药集团的战略重组和整体上市。

随着华润北药集团有限公司的成立，发展战略研讨会、财务工作会议、人力资源工作会议以及医药流通战略研讨会等一系列工作会议相继召开，华润北药“十二五”战略规划也随即启动。在加快推进体系建设的同时，华润北药在医药流通领域开展了大规模的收购整合工作，公司上下正为实现跨越式发展摩拳擦掌。华润北药的事业从此进入了一个新的纪元。